包皮过长时，容易集聚污垢，发生包。当污垢长期积存在皮下时，会形成结石，可于包皮下触摸到硬块体。 包皮口较紧者，部分包皮会因阴茎的勃起而卡在阴茎沟，造成局部肿胀和疼痛。有些患者，由于多次的包皮炎，使到包皮结疤、加厚，包皮口变窄，也容易产生包皮嵌夹在龟头后的阴茎沟，造成不适。 包皮口过小，人们称之（Phimosis），排尿时尿流细如线，包皮鼓起，甚至发生排尿困难的现象。 在处理方面，若是宽大的包皮过长，应该经常上翻清洗，不必强行外科手术。如果是屡屡发生包皮炎、包皮狭窄、开口太小者，可以施以包皮环切术。
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