包皮肿痛常见病因是包皮龟头炎引起。 包皮肿痛是包皮龟头炎很常见症状，包皮龟头炎因为包皮长，所以容易得包皮肿痛的毛病。还有别的问题，比如糖尿病或者免疫力缺陷，吃了抗免疫的药物；比如移植等等，需要吃免疫抑制剂。这个时候更容易出现包皮肿、包皮红、有渗出甚至溃疡，。偶然出现一次包皮龟头炎，没有关系的，只要保持清洁洗一洗，或者用点高锰酸钾或者外用的药，可以使用抗真菌的药物，还是有一定效果的。 如果反复的出现包皮红肿、炎症，就要考虑包皮长，或者是不是有糖尿病没处理好，血糖高不高，还有其的原因，比如免疫力的问题。
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