目前国际上的医生都认为子宫内膜异位症症状是由多种病因综合引起的，例如浆膜上皮、化生内膜、免疫防御功能缺陷、传与体质的因素、内分泌功能失调等。 组织上有内膜的腺体，在功能上随着雌激素水平而变化，随月经周期变化，会导致少量月经的现象。异位症还伴随不排卵，机制与患者卵泡细胞LH体有相应的关系，子宫内膜定期病理检查黄体期缺陷，发生率据报道为25%-40%，黄体功能不全可降低受孕率，还会增加自然流产的几率。 内分泌失调不能排卵；但是这两种原因都无法解释患者不育的问题。因为患有此疾病的患者月经是有规律的，并且排卵正常，输卵管通畅。
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