子宫内膜异位症症状是由多种病因综合引起的，例如化生内膜、浆膜上皮、免疫防御功能缺陷、传与体质的因素、内分泌功能失调等。 组织上有内膜的腺体，在功能上随着雌激素水平而变化，随着月经周期的变化，会引发少量月经的现象。异位症还伴随不排卵，机制和患者卵泡细胞LH体有相应的关系，子宫内膜定期病理检查黄体期缺陷，发生的几率据报道称在25%-40%左右，黄体功能不全可以降低女性受孕的几率，还可能增加自然流产的几率。 内分泌失调不能排卵：较为经常出现的是输卵管闭锁，就是阻碍了精子和卵子的结合；但这两种原因都不能解释患者不育的问题。
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